FlexS는 다른 하나에 대해 리간드들 중 하나의 형태와 방향을 예측한다. FlexS의 기준 - 리간드 따라서,이 속박 상태와 유사한 형태로 주어져야 강성 것으로 가정된다. FlexS의 중첩 알고리즘은 작은 수동 개입이 필요합니다. 수동으로 하나의 단계를 수행하여 FlexS와 계산에이 지식을 통합 할 수 있습니다. 따라서, FlexS은 리간드 쌍에뿐만 아니라 리간드 기반 가상 심사에 대한 대화 형 작업을 위해 설계되었습니다. FlexS의 두 가지 주요 응용 프로그램은 리간드 슈퍼 위치입니다 (예를. CoMFA / QSAR)에 가상 스크리닝. 당신이 단백질과 결합을 작은 분자 (소위 참조 - 리간드)하지만, 단백질의 구조가없는이있는 경우에, 당신은 활성 부위의 부정적인 지문으로 참조 구조를 취할 수 있습니다. FlexS 그들을 정렬하여 검사 및 참조 구조 사이의 유사성을 결정합니다. 가상 스크리닝에서는 참조 - 리간드 화합물의 세트를 가지고 있고 실험 테스트를 위해 화합물을 우선 순위에 관심이 있습니다.
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